在未來，受異常氣候導致的氣溫驟升影響，地表大部分區域都被水淹沒了。世界由大事務協調局進行管理，當局建議由機器人與仿生人承擔因氣溫上升而變得更為艱苦的體力勞動工作。而這里──是某一所『空房』。在這個被人們遺忘的地方，生活著鈷伯特、鉻洛姆、硅伊、氖恩四個無主仿生人。四人不知自己為何被制造出來，也不知自己為何在這里，只是重復著每一天的生活。──而他們與一位『少年』偶然『相遇』了。這是后來推動人類、仿生人，乃至整個世界的命運的開端。依靠著心中涌現的不知名程序，四人以王者“獨立式”統治的巴別塔頂點為目標展開了挑戰。